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星盈超级刀片计算机和生物信息学应用实例



北京卫生管理与医学信息研究所
生物医学超级计算与研究中心

2004年11月,蚬壳星盈与北京医学信息研究院合作建立了生物医学超级计算与研究中心,引进了一套星盈万亿次实时协作式超级刀片计算机系统,开展生物信息学、计算生物学、信息技术等方面的研究,向院内外科研人员提供计算服务,合作申请相关研究课题,为该院和国内生物信息学研究提供强大的平台条件。

该超级刀片计算机的系统结构为分布式内存的并行机群,配置132个计算节点,1个登录节点和I/O节点。每个节点拥有2个2.8GHz 的P4 Xeon CPU,2GB内存,36GB本地硬盘。系统配置2个2TB的高速磁盘阵列,且系统中所有节点之间都采用20Gbps的InfiniBand交叉开关高速互连,可以和传统的MPP(大规模并行处理)计算机媲美,亦可同时满足高通量计算和高性能并行计算应用的需要,实际运算能力超过

1万亿次浮点结果/秒,是目前安装在我国生物医学研究机构中性能最高、运算速度最快的系统。

详细内容请见:星盈超级刀片计算机和生物信息学应用方案

 
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