用户环境与需求
　　随着基因组学、蛋白质组学、生物信息学、计算机辅助药物设计等研究的开展，计算机技术在生物医学科研工作中的应用有了长足的发展，发挥着越来越重要的作用，生物信息学是生命科学和信息科学的结合，它的发展和应用离不开高性能计算资源、技术和方法的支撑。

为此，北京医学信息研究所需要引进一套高性能计算机，用于开展生物信息学、计算生物学、信息技术等方面的研究，向所内外科研人员提供计算服务，合作申请相关研究课题，并为该所和国内生物信息学研究提供强大的平台。

星盈解决方案
　　蚬壳星盈与北京医学信息研究所合作建立了生物医学超级计算与研究中心，引进了一套星盈万亿次实时协作式超级刀片计算机系统。

　　系统硬件配置：144个计算节点，1个登录节点和I/O节点。每个节点拥有 2 个 2.8GHz 的 Intel Xeon CPU，2GB内存，36GB本地硬盘。系统配置2个2TB的高速磁盘阵列，且系统中所有节点之间都采用20Gbps的InfiniBand交叉开关高速互连，可以和传统的MPP（大规模并行处理）计算机媲美，亦可同时满足高通量计算和高性能并行计算应用的需要，实际运算能力超过1.5万亿次/秒，是目前安装在我国生物医学研究机构中性能最高、运算速度最快的系统。

　　系统软件和开发工具：该系统安装了经过定制优化的RedHat Linux AS 3.1操作系统, MPI 开发工具组（编译器、库、运行时模块），以及计算资源管理、任务调度、性能监控、网络文件共享、并行环境等软件，实现系统的单一映像（SSI）。经过简单的培训，该中心在二周之内就移植安装了近二十种生物医学应用软件。

总体效果
　　在本生物信息学应用中，蚬壳星盈对应用系统进行定制设计和整体优化，极至地发挥了超级刀片计算机系统软、硬件固有的潜能。北京医学信息研究院的研究人员在超级刀片计算平台，使用Blat、EstAlign等程序研究基因转录和可变剪接等问题时，利用56个计算节点并行运行Blat，仅耗时7.5个小时就可完成UniGene数据库中五百多万条人类EST序列对基因组数据库的比对，而相同的任务若在一般的服务器上用双CPU的PC服务器需要3周时间。

在另外一项研究中，使用blastpgp和基于神经网络的结构预测程序，在3天内完成了16万个基因序列的突变比对和结构预测，而这在一般PC服务器上需要连续计算6个月。

关于应用平台的能力、特点及相关资源详见北京卫生管理与医学信息研究-生物医学超级计算与研究中心提供的：《星盈超级刀片计算机和生物信息学应用》